В 1905 в честь пятидесятилетней годовщины первой обороны Севастополя на месте древнего пещерного Софийского храма освящена Скорбященская церковь
Восстановительные и реставрационные работы проводились под руководством архитектора А. М. Вейзена.
В церкви хранились полковые образа войсковых частей, которые участвовали в Инкерманском сражении Крымской войны (1854).
Двухпрестольный крестообразный собор построен в византийском стиле. Сооружение создавалось в честь 50-летия со дня первой обороны Севастополя. Закрыли церковь с Иаковским приделом в 1926 году. Сооружение пострадало от землетрясения, которое было в здесь в далёком 1927 году. Здание было разрушено во время ВОВ (Великой Отечественной Войны).